Государственное управление деятельностью по обеспечению единства измерений в республике осуществляет Министерство экономики и финансов Кыргызской Республики (МЭиФ КР) в соответствии с законом Кыргызской Республики от 9 июля 2014 г. №118 "Об обеспечении единства измерений" я9в редакции Закона КР от 4 марта 2020 г. № 23).

Организационная структура национальной метрологической системы состоит из Министерства экономики и финансов Кыргызской Республики, Центра по стандартизации и метрологии при Министерстве экономики Кыргызской Республики и Управления метрологического надзора Государственной инспекции по экологической и технической безопасности при Правительстве Кыргызской Республики.